โรงเรียนบ้านดินแดงเดิมตั้งอยู่หมู่ที่ 10 ต.ลำทับ อ.คลองท่อม จ.กระบี่ ด้วยราษฎรในท้องถิ่นนำโดยกำนันลาภ ศรีสุข กำนันตำบลลำทับ นายเสริญ ช่วยแท่นและนายขุ้น คงประทุมและชาวบ้านมีความประสงค์จะจัดตั้งโรงเรียนเพื่ออำนวยความสะดวกให้แก่บุตรหลานที่ต้องเดินทางไปเรียนไกลๆ ราษฎรได้ร่ววมกันสร้างอาคารเรียนชั่วคราว 1 หลัง บนที่ดินสาธารณประโยชน์จำนวน 10 ไร่ 2 งาน ต่อมาทางราชการจัดตั้งเป็นโรงเรียนประชาบาล สังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดกระบี่

เมื่อ พ.ศ.2521 เป็นสาขาของโรงเรียนบ้านหนองจูด (แบบ ป.1 ก) ต่อมาทางราชการให้นายเยื้อน ทวีพรวัฒนกุล มาช่วยราชการแต่ยังไม่ดำรงตำแหน่งเพราะได้บรรจุนายเยื้อน ไปดำรงตำแหน่งครูใหญ่โรงเรียนบ้านคลองไคร จึงได้ให้นายสมหมาย แก้วสนั่น ครูใหญ่โรงเรียนบ้านหนองจูด (องค์การสวนยาง 4 ) มาช่วยราชการและรักษาการในตำแหน่งครูใหญ่

เมื่อวันที่ 10 พฤษภาคม พ.ศ.2521 จนถึงปี พ.ศ.2529 และได้บรรจุข้าราชการครูมาโดยตลอด ต่อมาวันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ. 2530 ทางราชการได้แต่งตั้งนายบุญสงค์ เหรียญขำ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ อาจารย์ใหญ่และผู้อำนวยการจนเกษียณอายุราชการ ดร.ศักดิ์จิต มาศจิตต์ได้เข้ามาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการวันที่ 1 ธันวาคม พ.ศ.2552 จนถึงวันที่ 1 พฤศจิกายน พ.ศ. 2555 หลังจากนั้นนายเอกราช กลิ่นคล้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการวันที่ 2 พฤศจิกายน พ.ศ. 2555 จนถึงวันที่ 29 มกราคม พ.ศ. 2558 และนายสุชาติ สุขไกร ได้มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านดินแดง ในวันที่ 16 กรกฎาคม พ.ศ.2558 จนถึงปัจจุบัน